Самый простой вариант - поставить буржуйку. Размер подбирать исходя из площади помещения. Единственное, я не знаю, как поликарбонат себя поведёт - не будет ли плавиться под воздействием горячего воздуха. Надо что-то с дымоходом продумать, чтобы изолировать его от поликарбоната.
Подойдет любой теплоизоляционный вариант. Та же труба из асбеста поможет избежать нагрева вашего поликарбоната. Только если уж вы пользуетесь теплицей и зимой, то не проще построить уже капитальное помещение?